Also ich kann dir deine Frage nicht ganz beantworten (AR kommt diese Woche aber, dann kann ich dir mit Sicherheit antworten, wenn ich dran denken sollte.

).
Stell dir vor, du hättest ein normales Spiel, dann wären die ja auch im selben Slot, nicht?
Der Action Replay für den Ds funktioniert so:
Du steckst das Cheatmodul rein, suchst dir ein Spiel aus, holst es raus und steckst dein Spielmodul rein.
Das Spiel sollte dann erkannt werden und dir werden eine Liste von aktivierbaren Codes angezeigt, und genau hier könnte das Problem mit den Flashcards eintreten.
Es könnte natürlich sein, dass nur die Software der Flashcard erkannt wird und so gar nichts passiert, wobei der Action Replay dann das nachher gestartete Spiel ignoriert.
Was natürlich optimal wäre: Er erkennt es nachher trotzdem, was ich auch hoffe.
Dann noch eine Sache: Ich weiß nicht genau, wie so ein Cheatmodul funktioniert, also ob es irgendwelche Daten im Spielmodul selber zeitweise manipuliert (was schlecht wäre) oder ob es einfach auf die Software zugreift (wie CheatEngine am PC z.B.). Bei letzterem sollte es keine Probleme geben.
Hoffe etwas geholfen zu haben...